Am 21. September 2008 trafen sich die ersten 30 Mitglieder zur Gründungsversammlung im Gasthof "Fegetasche" in Plön. Initiiert von einer Gruppe Freier Wähler auf kommunaler Ebene wurde eine landesweit tätige Partei ins Leben gerufen, die dem Gedanken der Unabhängigkeit von Lobbygruppen, die freie Meinungsäußerung sowie die Beteiligung der Bevölkerung an den Entscheidungen in der Politik verbunden ist.
Innerhalb kürzester Zeit kamen weitere Mitglieder dazu, im Jahr 2009 waren es fast 200 Mitgliedern landesweit.

 
Zur Landtagswahl im September 2009 traten die Freien Wähler Schleswig-Holstein erstmals landesweit an, alle Wahlkreise konnten mit Direktkandidaten besetzt werden. Am Ende lag das Wahlergebnis landesweit bei 16.362 Stimmen, das entsprach einem Stimmenanteil von 1% aller abgegebenen Stimmen.

 
In der darauf folgenden Zeit trat eine Konsoldierungsphase ein. Diverse Wechsel im Vorstand sowie interne Probleme führten zu Parteiaustritten. Mittlerweile hat die Partei der Freien Wähler eine Mitgliederzahl von knapp 60 Aktiven. Dieser harte Kern tritt an, mit Hilfe der echten Freien Wähler im Lande Schleswig-Holstein erneut für den Landtag im Mai 2012 zu kandidieren.